方荣祥，植物病毒学和植物生物技术专家。生于上海，原籍安徽绩溪。1967年毕业于复旦大学。现任中国科学院微生物研究所研究员、所长，植物生物技术重点实验室主任。分析了流感病毒血凝素基因序列及其变异的特点，阐述了1968年香港流感病毒基因可能来自于动物流感病毒的观点。完成了花椰菜花叶病毒（新疆株）和水稻黄矮病毒基因组全序列分析，发现了弹状病毒中的一个新基因。研制成同时抗烟草花叶病毒和黄瓜花叶病毒的转基因烟草，在种植时间和规模上曾居国际领先同样的策略还用于抗病毒辣椒的研制。在植物生物技术的基础研究方面，分析和改造了花椰菜花叶病毒35S启动子，研究结果被广泛应用界定了水稻细胞壁蛋白GRP基因启动子中负责维管束特异表达的DNA序列发现了融合CMV外壳蛋白多肽可大幅度提高外源蛋白的表达水平。
2003年当选为中国科学院院士。